根據中央建設創新型國家的總體戰略目標和國家中長期科技發展規劃綱要，結合科技布局調整的要求，圍繞深圳市實施創新型城市戰略，2006年2月，深圳市人民政府及香港中文大學友好協商，在深圳市共同建立中國科學院深圳先進技術研究院，實行理事會管理，探索體制機制創新。
中國科學院深圳先進技術研究院實行理事會制度，由中科院和深圳市政府各委派3人組成，實行雙組長制，其主要職責是確定年度建設計劃。
黨委書記：楊建華
黨委書記
1970年3月出生，湖南安鄉人。中國科學技術大學管理學碩士。2002年至2003年在美國哈佛大學肯尼迪政府學院從事高級訪問研究。歷任中國科學院辦公廳秘書、院團委副書記、書記，中國科學院研究生院（現中國科學院大學）院長助理，中國科學院科學時報社（現中國科學報社）副社長、黨委副書記、書記，中關村科技園區管委會黨組成員、副主任（正局級），中國科學院廣州分院副院長（正局級）、分黨組成員。現兼任國家行政學院、中國浦東干部學院兼職教授。主要從事技術創新管理、創新創業、科技金融創新等方面的研究工作。
